Peralta and Spooner, GBSSI gene sequence insertion/deletion data (indels scored as binary or multistate characters), tomatoes and outgroups.
|
1 10 20 |
|
|
12345678901234567890 |
|
|
S. mur Anderson 844 |
00000000000011010101 |
|
S. etb PI 498311 |
10101210101011010101 |
|
S. pal PI 218228 |
10101210101011010101 |
|
S. tbr |
20202121302101111101 |
|
S. blb PI 347757 |
20202220202001111101 |
|
S. jam PI 458424 |
20202220202001111101 |
|
S. jgl LA 2134 |
32302232404001201100 |
|
S. jgl LA 2788 |
32302232404001201100 |
|
S. och LA 2682 |
32302232404001201100 |
|
S. och LA 3650 |
32302232404001201100 |
|
S. lyc LA 1964 |
41413343513201202100 |
|
S. lyc LA 1990 |
41413343513201202100 |
|
S. sit LA 2876 |
41413343513201202100 |
|
S. sit LA 2878 |
41413343513201202100 |
|
S. lypc LA 1673 |
52514354614001201100 |
|
S. lypc LA 1334 |
52514354614001201100 |
|
S. lypc LA 1226 |
52514354614001201100 |
|
S. lyp cv MS |
52514354614001201100 |
|
S. pim LA 722 |
52514354614001201100 |
|
S. pim LA 1237 |
52514354614001201100 |
|
S. pim LA 1581 |
52514354614001201100 |
|
S. pim LA 2184 |
52514354614001201100 |
|
S. chs LA 166 |
52514354614001201100 |
|
S. chsm LA 317 |
52514354614001201100 |
|
S. chs LA 1450 |
52514354614001201100 |
|
S. neo LA 247 |
52514354614000201100 |
|
S. neo LA 1326 |
52514354614000201100 |
|
S. neo LA 2200 |
52514354614000201100 |
|
S. chm LA 1306 |
52514354614000201100 |
|
S. chm LA 1327 |
52514354614000201100 |
|
S. chm LA 2663 |
52514354614000201100 |
|
S. per LA 2185 |
52514354614001201100 |
|
S. per LA 2172 |
52514354614001201100 |
|
S. per LA 2163 |
52514354614001201100 |
|
S. per LA 2157 |
52514354614001201100 |
|
S. per LA 392 |
52515354614001201100 |
|
S. per LA 1351 |
52515354614001201000 |
|
S. per LA 441 |
52515354614001201000 |
|
S. per LA 1609 |
52515354614001201100 |
|
S. perh LA 2152-1 |
52515354614001201000 |
|
S. perh LA 2152-3 |
52514354614001201100 |
|
S. perh LA 2548 |
52514354614001201100 |
|
S. per LA 1396 |
52514354614001201100 |
|
S. per LA 378 |
52514354614001201100 |
|
S. per LA 1984 |
52514354614001201100 |
|
S. per LA 2328 |
52514354614001201100 |
|
S. per LA 1626 |
52514354614001201100 |
|
S. per LA 1556-1 |
52514354614001201100 |
|
S. per LA 444 |
52504354614001201100 |
|
S. per LA 448 |
52514354614001201100 |
|
S. per LA 1336-2 |
52514354614001201100 |
|
S. per LA 110-1 |
52514354614001201100 |
|
S. perg LA 1283 |
52505354614001201100 |
|
S. per LA 1913 |
52515354614001201100 |
|
S. per LA 107 |
52505354614001201100 |
|
S. per LA 1305 |
52515354614001201100 |
|
S. per LA 1910 |
52515354614001201100 |
|
S. per LA 1973 |
52515354614001201100 |
|
S. per LA 110-2 |
52516354614001201100 |
|
S. per LA 153 |
52516354614001201100 |
|
S. per LA 111-1 |
52516354614001201100 |
|
S. per LA 111-3 |
52516354614001201100 |
|
S. per LA 1379 |
52516354614001201100 |
|
S. per LA 1274 |
52516354614001201100 |
|
S. per LA 370 |
52516354614001201100 |
|
S. per LA 103 |
52516354614001201100 |
|
S. per LA 1331 |
52516354614001201100 |
|
S. per LA 1937 |
52516354614001201100 |
|
S. per LA 1336-1 |
52516354614001201100 |
|
S. per LA 451 |
52516354614001201100 |
|
S. per LA 3156 |
52516354614001201100 |
|
S. per LA 1954 |
52516354614001201100 |
|
S. per LA 2964 |
52516354614001201100 |
|
S. per LA 2744 |
52516354614001201100 |
|
S. chl LA 1963 |
52505354614001201100 |
|
S. chl LA 2884 |
52505354614001201100 |
|
S. chl LA 1930 |
52515354614001201100 |
|
S. habg LA 1223 |
52506354614001201110 |
|
S. hab LA 1353 |
52506334614001201110 |
|
S. hab LA 1928 |
52506354614001201110 |
|
S. pen LA 716 |
52506354614001201100 |
|
S. pen LA 1376 |
52516354614001201100 |
|
S. penp LA 1926 |
52506354614001201100 |
NOTE: LA numbers are from The C. M. Rick Tomato Genetics Resource Center; PI numbers are the same United States Plant Introduction Number duplicate accessions held at the United States Department of Agriculture genebank in Geneva, New York (Geneva Plant Genetic Resources Unit, NE-9) (see Table 1). Distinct GBSSI sequence types from different clones obtained from single individuals of seven accessions are indicated in italic and a number (see Table 2).
Supplementary material to Peralta I, Spooner, DM. (2001) "Granule-bound starch synthase (GBSSI) gene phylogeny of wild tomatoes (Solanum L. section Lycopersicon [Mill.] Wettst. subsection Lycopersicon)." Am. J. Bot. 88: